Una nueva prueba de biopsia líquida puede identificar rápidamente el ADN del cáncer en pacientes con cáncer de mama metastásico

Una nueva prueba de biopsia líquida puede identificar rápidamente el ADN del cáncer en pacientes con cáncer de mama metastásico
Una nueva prueba de biopsia líquida puede identificar rápidamente el ADN del cáncer en pacientes con cáncer de mama metastásico

Una nueva prueba de biopsia líquida automatizada en desarrollo por investigadores del Johns Hopkins Kimmel Cancer Center puede detectar con precisión la presencia de ADN canceroso en la sangre de pacientes con cáncer de mama metastásico en cinco horas. La prueba, actualmente un prototipo solo para uso en investigación, podría usarse potencialmente para ayudar rápidamente a los oncólogos a determinar si los tratamientos contra el cáncer están funcionando.

La prueba, denominada Biopsia líquida para la metilación del cáncer de mama (LBx-BCM), es compatible con una plataforma de pruebas moleculares comercialmente disponible llamada GeneXpert.® y puede detectar la metilación, un tipo de etiqueta química, en uno o más de los nueve genes alterados en los cánceres de mama en 4,5 horas. Requiere menos de 15 minutos de tiempo práctico por parte de un técnico de laboratorio. Una validación de la prueba y sus posibles usos se publicó en línea el 6 de mayo en la revista Comunicaciones de investigación del cáncer.

Muchas pacientes con cáncer de mama no responden a la quimioterapia, sino que pasan por varios ciclos de tratamiento antes de que los equipos de oncología puedan realizar estudios por imágenes para determinar si un tratamiento es efectivo, explica la autora principal del estudio, Saraswati Sukumar, Ph.D., profesora de oncología y patología en el la Facultad de Medicina de la Universidad Johns Hopkins. Las imágenes pueden ser efectivas para detectar cambios en tumores más grandes, pero es casi imposible identificar cambios en tumores más pequeños, dice Sukumar.

Nuestro objetivo era desarrollar un ensayo que fuera sofisticado pero simple de realizar en todo el mundo y que pudiera usarse en el punto de atención para brindar retroalimentación el mismo día a médicos y pacientes. Si somos capaces de demostrar mediante este ensayo de cartucho que, de hecho, tenemos éxito en la predicción del curso del tratamiento, podríamos instituir cambios en la forma en que vemos la quimioterapia y la forma en que tratamos a los pacientes con cáncer de mama metastásico”.

Saraswati Sukumar, Ph.D., profesora de oncología y patología, Escuela de Medicina de la Universidad Johns Hopkins

Con la prueba LBx-BCM, desarrollada en colaboración con científicos de Cephied, un técnico puede colocar muestras de sangre o plasma de pacientes con cáncer en tubos que contienen un reactivo, una mezcla utilizada para extraer ADN, y colocar el contenido en cartuchos para que el sistema comercial modificar químicamente el ADN y luego amplificar y detectar genes metilados, arrojando resultados rápidamente. El ensayo busca marcadores de metilación (alteraciones químicas del ADN específicas de las células cancerosas) entre un panel de nueve genes que reconocen los cuatro subtipos de cáncer de mama. Los genes son AKR1B1, TM6SF1, ZNF671, TMEFF2, COL6A2, HIST1H3C, RASGRF2, HOXB4 y RASSF1.

El equipo de Johns Hopkins desarrolló previamente un ensayo de laboratorio de biopsia líquida llamado cMethDNA, que identificó la presencia de hipermetilación entre 10 genes alterados en los cánceres de mama. La hipermetilación es una alteración química del ADN que a menudo silencia la función de los genes que mantienen bajo control el crecimiento celular descontrolado. Su aparición en el ADN de los genes relacionados con el cáncer de mama que se derraman en la sangre indica que el cáncer ha regresado o se ha propagado. La prueba puede detectar hasta el 90 % de los pacientes con cáncer de mama metastásico y puede ayudar a predecir la respuesta al tratamiento y los resultados de los pacientes a largo plazo. Sin embargo, tarda 10 días en completarse y requiere un alto grado de competencia técnica. LBx-BCM se basa en este trabajo y, debido a que está automatizado, toma mucho menos tiempo, dice Mary Jo Fackler, Ph.D., autora principal del estudio.

Para probar LBx-BCM, los investigadores primero hicieron que dos personas realizaran la prueba en días separados, utilizando muestras almacenadas de 11 pacientes con cáncer de mama metastásico y cuatro sin cáncer de mama. Los resultados fueron los mismos en más del 90% de los casos.

También estudiaron la capacidad de la prueba para detectar cáncer de mama metastásico en dos conjuntos de muestras de estudios previos en Johns Hopkins. Examinaron la metilación acumulada de los nueve genes en 20 muestras de suero de pacientes con cáncer de mama metastásico y 20 de personas sin cáncer de mama. Se analizó un segundo conjunto de muestras de 40 personas con cáncer de mama metastásico, 17 con enfermedad mamaria benigna y nueve sin cáncer de mama. En ambos conjuntos, LBx-BCM detectó de dos a 200 veces más ADN metilado en muestras de plasma de personas con cáncer de mama que en muestras normales o benignas.

Se encontró que la prueba detecta correctamente el cáncer el 83 % de las veces y descarta correctamente el cáncer el 92 % de las veces, con una precisión diagnóstica general del 85 %.

“Más ensayos clínicos prospectivos evaluarán la sensibilidad de detección de LBx-BCM y su capacidad para controlar la respuesta terapéutica durante el tratamiento del cáncer de mama avanzado”, escribieron Sukumar y sus colegas.

Además de Sukumar y Fackler, otros investigadores fueron Claudia Mercado-Rodríguez, Leslie Cope, Bradley Downs, Abdul Hussain Vali, Jennifer Lehman, Rita Denbow, Jeffrey Reynolds, Morgan Buckley, Kala Viswanathan, Christopher Umbricht, Antonio Wolff y Vered Stearns de Johns. Hopkins; Suzana Tulac, Neesha Venkatesan, Adam Aslam, Timothy de Guzman, Michael Bates y Edwin Lai de Cepheid, Sunnyvale, California; y Wanjun Ding del Hospital Renmin de la Universidad de Wuhan, China.

El trabajo fue apoyado por el Departamento de Defensa (subvención W81XWH-18-1-0018) y un acuerdo de investigación de Cepheid.

Sukumar, Fackler y Wolff son inventores del ensayo cMethDNA, patente estadounidense US10450609B2, y también recibieron patentes internacionales presentadas a través de la Universidad Johns Hopkins.

Fuente:

Referencia de la revista:

Fackler, MJ, et al. (2022) Desarrollo de un ensayo de biopsia líquida automatizado para marcadores metilados en cáncer de mama avanzado. Comunicaciones de investigación del cáncer. doi.org/10.1158/2767-9764.CRC-22-0133.

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